MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mannheimia haemolytica USMARC_2286

Total Repeats: 51682

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_021883	TTC	2	6	204917	204922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526467598
4003	NC_021883	TGA	2	6	204957	204962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467598
4004	NC_021883	T	6	6	204975	204980	0 %	100 %	0 %	0 %	526467598
4005	NC_021883	AAT	2	6	204981	204986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467598
4006	NC_021883	TGA	2	6	204995	205000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467598
4007	NC_021883	TTTTGT	2	12	205007	205018	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	526467598
4008	NC_021883	TAA	2	6	205088	205093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467598
4009	NC_021883	AAT	2	6	205119	205124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467598
4010	NC_021883	ATT	2	6	205173	205178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467598
4011	NC_021883	GGT	2	6	205194	205199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526467598
4012	NC_021883	TCA	2	6	205212	205217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467598
4013	NC_021883	A	6	6	205225	205230	100 %	0 %	0 %	0 %	526467598
4014	NC_021883	AATA	2	8	205294	205301	75 %	25 %	0 %	0 %	526467598
4015	NC_021883	TTTG	2	8	205311	205318	0 %	75 %	25 %	0 %	526467598
4016	NC_021883	TTAA	2	8	205329	205336	50 %	50 %	0 %	0 %	526467598
4017	NC_021883	ATA	2	6	205344	205349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467598
4018	NC_021883	AG	4	8	205353	205360	50 %	0 %	50 %	0 %	526467598
4019	NC_021883	GCC	2	6	205368	205373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526467598
4020	NC_021883	TAA	2	6	205409	205414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467598
4021	NC_021883	ATT	2	6	205424	205429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467598
4022	NC_021883	TTG	2	6	205436	205441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526467598
4023	NC_021883	TAA	2	6	205442	205447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467598
4024	NC_021883	TGAA	2	8	205460	205467	50 %	25 %	25 %	0 %	526467598
4025	NC_021883	CTT	2	6	205534	205539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526467598
4026	NC_021883	T	6	6	205585	205590	0 %	100 %	0 %	0 %	526467598
4027	NC_021883	CTG	2	6	205591	205596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467598
4028	NC_021883	TTC	2	6	205616	205621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526467598
4029	NC_021883	TCT	2	6	205635	205640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526467598
4030	NC_021883	AT	3	6	205726	205731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_021883	T	8	8	205755	205762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_021883	CTAT	2	8	205763	205770	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4033	NC_021883	T	6	6	205787	205792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_021883	T	6	6	205820	205825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_021883	TTGT	2	8	205833	205840	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_021883	TAAAT	2	10	205855	205864	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_021883	ATT	2	6	205894	205899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467599
4038	NC_021883	GCA	2	6	205924	205929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526467599
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4040	NC_021883	ATT	2	6	205995	206000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467599
4041	NC_021883	GA	3	6	206054	206059	50 %	0 %	50 %	0 %	526467599
4042	NC_021883	AT	3	6	206082	206087	50 %	50 %	0 %	0 %	526467599
4043	NC_021883	CAT	2	6	206118	206123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467599
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4045	NC_021883	TGAT	2	8	206195	206202	25 %	50 %	25 %	0 %	526467599
4046	NC_021883	TG	3	6	206203	206208	0 %	50 %	50 %	0 %	526467599
4047	NC_021883	TGA	2	6	206211	206216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467599
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4050	NC_021883	GACT	2	8	206309	206316	25 %	25 %	25 %	25 %	526467599
4051	NC_021883	TATT	2	8	206365	206372	25 %	75 %	0 %	0 %	526467599
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4053	NC_021883	TGA	2	6	206421	206426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467599
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4055	NC_021883	TAT	2	6	206478	206483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467599
4056	NC_021883	A	6	6	206545	206550	100 %	0 %	0 %	0 %	526467599
4057	NC_021883	ATTG	2	8	206554	206561	25 %	50 %	25 %	0 %	526467599
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4062	NC_021883	TGC	2	6	206772	206777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467600
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4072	NC_021883	TGC	2	6	207138	207143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467600
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4088	NC_021883	ATC	2	6	207818	207823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467600
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4090	NC_021883	ATT	2	6	207903	207908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467600
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4092	NC_021883	AGA	2	6	207959	207964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_021883	TAT	2	6	207984	207989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_021883	GAA	2	6	208222	208227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526467601
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4097	NC_021883	GGCA	2	8	208271	208278	25 %	0 %	50 %	25 %	526467601
4098	NC_021883	AAG	2	6	208340	208345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526467601
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4102	NC_021883	AAC	2	6	208511	208516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467601
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4105	NC_021883	CGG	2	6	208622	208627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526467601
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4107	NC_021883	CAA	2	6	208810	208815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467601
4108	NC_021883	A	7	7	208830	208836	100 %	0 %	0 %	0 %	526467601
4109	NC_021883	TGA	2	6	208878	208883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467601
4110	NC_021883	TGAG	2	8	209009	209016	25 %	25 %	50 %	0 %	526467601
4111	NC_021883	TTC	2	6	209182	209187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526467601
4112	NC_021883	GAA	2	6	209281	209286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526467601
4113	NC_021883	GTTTG	2	10	209316	209325	0 %	60 %	40 %	0 %	526467601
4114	NC_021883	CTTA	2	8	209330	209337	25 %	50 %	0 %	25 %	526467601
4115	NC_021883	ATC	2	6	209413	209418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467601
4116	NC_021883	CGG	2	6	209439	209444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526467601
4117	NC_021883	AAATA	2	10	209504	209513	80 %	20 %	0 %	0 %	526467601
4118	NC_021883	A	6	6	209579	209584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_021883	TGG	2	6	209586	209591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_021883	GAT	2	6	209649	209654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467602
4121	NC_021883	GTA	2	6	209707	209712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467602
4122	NC_021883	GTT	2	6	209713	209718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526467602
4123	NC_021883	GGT	2	6	209742	209747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526467602
4124	NC_021883	TCA	2	6	209795	209800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467602
4125	NC_021883	ATC	2	6	209809	209814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467602
4126	NC_021883	TTGCA	2	10	209827	209836	20 %	40 %	20 %	20 %	526467602
4127	NC_021883	TGG	2	6	209845	209850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526467602
4128	NC_021883	GGT	2	6	209859	209864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526467602
4129	NC_021883	TTC	2	6	209887	209892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526467602
4130	NC_021883	CCA	3	9	209961	209969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467602
4131	NC_021883	GCT	2	6	209981	209986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467602
4132	NC_021883	TTG	2	6	210023	210028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526467602
4133	NC_021883	TG	3	6	210153	210158	0 %	50 %	50 %	0 %	526467602
4134	NC_021883	T	6	6	210186	210191	0 %	100 %	0 %	0 %	526467602
4135	NC_021883	ATC	2	6	210232	210237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467602
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4138	NC_021883	GTTG	2	8	210393	210400	0 %	50 %	50 %	0 %	526467602
4139	NC_021883	AAT	2	6	210416	210421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467602
4140	NC_021883	T	6	6	210552	210557	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4141	NC_021883	TAT	2	6	210560	210565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4142	NC_021883	TTA	2	6	210673	210678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467603
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4144	NC_021883	A	6	6	210750	210755	100 %	0 %	0 %	0 %	526467603
4145	NC_021883	CAA	2	6	210828	210833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467603
4146	NC_021883	CAC	2	6	210835	210840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467603
4147	NC_021883	TTTA	2	8	210857	210864	25 %	75 %	0 %	0 %	526467603
4148	NC_021883	TGA	2	6	210893	210898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467603
4149	NC_021883	GTG	2	6	210975	210980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526467603
4150	NC_021883	GGCA	2	8	211082	211089	25 %	0 %	50 %	25 %	526467603
4151	NC_021883	CTTG	2	8	211143	211150	0 %	50 %	25 %	25 %	526467603
4152	NC_021883	GT	3	6	211192	211197	0 %	50 %	50 %	0 %	526467603
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4156	NC_021883	AT	3	6	211346	211351	50 %	50 %	0 %	0 %	526467603
4157	NC_021883	GCA	2	6	211467	211472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526467603
4158	NC_021883	CGGTAG	2	12	211507	211518	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	526467603
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4160	NC_021883	TGA	2	6	211526	211531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467603
4161	NC_021883	TAC	2	6	211597	211602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467603
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4166	NC_021883	TAA	2	6	212160	212165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467603
4167	NC_021883	T	6	6	212178	212183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4168	NC_021883	T	6	6	212211	212216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4170	NC_021883	TTTGG	2	10	212341	212350	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
4171	NC_021883	AT	3	6	212364	212369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4172	NC_021883	ATTT	2	8	212383	212390	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4173	NC_021883	TAT	2	6	212401	212406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4185	NC_021883	GT	3	6	213092	213097	0 %	50 %	50 %	0 %	526467604
4186	NC_021883	ATT	2	6	213127	213132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467604
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4223	NC_021883	TAT	2	6	215326	215331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467606
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4225	NC_021883	GCTG	2	8	215382	215389	0 %	25 %	50 %	25 %	526467606
4226	NC_021883	GTTTAG	2	12	215406	215417	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	526467606
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4230	NC_021883	AGC	2	6	215704	215709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526467606
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4232	NC_021883	CGG	2	6	215872	215877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526467606
4233	NC_021883	G	6	6	215890	215895	0 %	0 %	100 %	0 %	526467606
4234	NC_021883	CAT	2	6	215917	215922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467606
4235	NC_021883	ATT	2	6	215930	215935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467606
4236	NC_021883	TAC	2	6	215981	215986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467606
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4241	NC_021883	TGG	2	6	216421	216426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526467607
4242	NC_021883	CAA	2	6	216555	216560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467607
4243	NC_021883	ACC	2	6	216606	216611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467607
4244	NC_021883	ATT	2	6	216627	216632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467607
4245	NC_021883	GGT	2	6	216653	216658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526467607
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4247	NC_021883	CAAAGC	2	12	216728	216739	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	526467607
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4371	NC_021883	CCGA	2	8	221897	221904	25 %	0 %	25 %	50 %	526467612
4372	NC_021883	AAT	2	6	221917	221922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467612
4373	NC_021883	ACC	2	6	222004	222009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467612
4374	NC_021883	AGT	2	6	222160	222165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467612
4375	NC_021883	CCT	2	6	222176	222181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4376	NC_021883	CGGT	2	8	222205	222212	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4377	NC_021883	ATTT	2	8	222239	222246	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4378	NC_021883	A	7	7	222270	222276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4379	NC_021883	ATG	2	6	222393	222398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4380	NC_021883	GT	3	6	222403	222408	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4381	NC_021883	TTG	2	6	222421	222426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4382	NC_021883	ATC	2	6	222452	222457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467613
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4385	NC_021883	TACGG	2	10	222589	222598	20 %	20 %	40 %	20 %	526467613
4386	NC_021883	TTC	2	6	222615	222620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526467613
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4393	NC_021883	TGCG	2	8	223365	223372	0 %	25 %	50 %	25 %	526467613
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4401	NC_021883	CCCG	2	8	223781	223788	0 %	0 %	25 %	75 %	526467613
4402	NC_021883	CAT	2	6	223826	223831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467613
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4414	NC_021883	GTTTT	2	10	224405	224414	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4415	NC_021883	A	6	6	224417	224422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4416	NC_021883	A	6	6	224472	224477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4417	NC_021883	TGA	2	6	224522	224527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4418	NC_021883	CATA	2	8	224539	224546	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4419	NC_021883	C	8	8	224549	224556	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4420	NC_021883	TTTTAT	2	12	224576	224587	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4421	NC_021883	ATTGAT	2	12	224806	224817	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	526467614
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4428	NC_021883	TAC	2	6	225163	225168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467614
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4436	NC_021883	AAAT	2	8	225692	225699	75 %	25 %	0 %	0 %	526467614
4437	NC_021883	GTAT	2	8	225945	225952	25 %	50 %	25 %	0 %	526467614
4438	NC_021883	TAT	2	6	226127	226132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467615
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4445	NC_021883	ATG	2	6	226380	226385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467615
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4449	NC_021883	ATTG	2	8	226643	226650	25 %	50 %	25 %	0 %	526467615
4450	NC_021883	GGC	2	6	226775	226780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526467615
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4454	NC_021883	CTG	2	6	226893	226898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467615
4455	NC_021883	CTT	2	6	226955	226960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526467615
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4463	NC_021883	GCA	2	6	227316	227321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526467615
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4465	NC_021883	A	6	6	227438	227443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4466	NC_021883	AATG	2	8	227464	227471	50 %	25 %	25 %	0 %	526467616
4467	NC_021883	GTG	2	6	227579	227584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526467616
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4479	NC_021883	GTT	2	6	228465	228470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526467617
4480	NC_021883	CTTG	2	8	228509	228516	0 %	50 %	25 %	25 %	526467617
4481	NC_021883	TAA	2	6	228542	228547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467617
4482	NC_021883	TCC	2	6	228579	228584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4483	NC_021883	TATTTA	2	12	228590	228601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467618
4484	NC_021883	TTA	2	6	228608	228613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467618
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4486	NC_021883	A	7	7	228668	228674	100 %	0 %	0 %	0 %	526467618
4487	NC_021883	TCTT	2	8	228686	228693	0 %	75 %	0 %	25 %	526467618
4488	NC_021883	A	6	6	228733	228738	100 %	0 %	0 %	0 %	526467618
4489	NC_021883	T	6	6	228809	228814	0 %	100 %	0 %	0 %	526467618
4490	NC_021883	A	6	6	228873	228878	100 %	0 %	0 %	0 %	526467619
4491	NC_021883	TTC	2	6	228951	228956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526467619
4492	NC_021883	AGC	2	6	228965	228970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526467619
4493	NC_021883	CTT	2	6	229054	229059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526467619
4494	NC_021883	AAG	2	6	229066	229071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526467619
4495	NC_021883	AGC	2	6	229079	229084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526467619
4496	NC_021883	TGGT	2	8	229177	229184	0 %	50 %	50 %	0 %	526467620
4497	NC_021883	GCA	2	6	229264	229269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526467620
4498	NC_021883	TGATT	2	10	229303	229312	20 %	60 %	20 %	0 %	526467620
4499	NC_021883	TTA	2	6	229352	229357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467620
4500	NC_021883	GTA	2	6	229445	229450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467620

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